吉林敖東延邊藥業股份有限公司依托國家級企業技術中心和博士后科研工作站的技術優勢，通過與國內重點院校及科研機構建立良好的長期合作關系，建立了集產、學、研于一體的科研團隊及創新平臺。
　　公司始終堅持以科技創新為重點，不斷加大科研力度，采用自主開發、聯合開發與技術轉讓等多種科研開發模式，不斷研究、開發、應用國內外先進的新技術、新工藝、新材料，逐步形成了集科研開發、生產制造為一體的創新型高新技術企業。通過多年的科研實踐，建立了符合公司發展的平臺和科研隊伍并形成符合自身特點的工作流程。
　　公司先后同國內重點院校、科研機構和國家藥物臨床試驗機構建立了多種形式、長期穩定的合作關系，遵循“生產—開發—預研—構思”的新品種開發戰略，找準新產品定位，以市場導向、技術領先、差異化原則，持續進行自主創新工作。公司制定了《產品研發、審評工作程序》，明確規定了工作程序，從新藥立項審批、調研評估、合同審核、費用預算、過程跟蹤、知識產權保護、商業保密等環節制定了具體的操作標準。目前已開發新產品20個，取得新藥證書20個，中藥保護品種7個。公司在研品種10個，正在辦理轉讓品種7個。獲得有效專利35個，其中外觀專利15個，發明專利19個，實用新型專利1個。目前公司共有藥品174個品種，205個批準文號。